- Colectiv pentru culturi de alge
- Colectiv de hidrobiologie, hidrochimie
- Colectiv de microbiologie acvatică
- Centrul de consiliere. Transfer tehnologic si protecția mediului
- Colectiv de tehnologii,genetică și ameliorare în acvacultură
- Colectiv de patologia și fiziologia vieţuitoarelor acvatice
- Colectiv pentru procesarea, calitatea și siguranța produselor din acvacultură și pescuit
- Colectiv de evaluare a resurselor acvatice din habitatele naturale și amenajate
- Colectiv pentru reproducere artificială și creșterea speciilor de pești valoroase
- Colectiv tehnici și unelte de pescuit
- Colectiv de cercetări agro-pescărești punct de lucru Brateș
- Colectiv de genofonduri pescărești punct de lucru Cotu Chiului